Quận Amador đã được thành lập năm 1854 từ các khu vực của các quận Calaveras và El Dorado. Năm 1864, một phần lãnh thổ của quận đã được chuyển sang Quận Alpine.

Quận được đặt tên theo Jose Maria Amador, một người lính, người chủ trang trại chăn nuôi, người khai khoáng, sinh ra tại San Francisco năm 1794, là con trai của trung sỹ Pedro Amador, một người lính Tây Ban Nha đã định cư ở California năm 1771. Năm 1848, Jose Maria Amador, với nhiều thổ dân châu Mỹ đã thiết lập một trại khai thác vàng thành công ở gần chỗ mà ngày nay là thành phố Amador. Trong tiếng Tây Ban Nha, từ amador có nghĩa là "người yêu."